Cuando se realiza un muestreo activo, el primer paso es calibrar la bomba para valorar de forma precisa el caudal y  ajustarlo al recomendado por el método de toma de muestra correspondiente.

El fundamento consiste en medir el tiempo que tarda la bomba en aspirar un volumen de aire conocido, obteniéndose el caudal de aspiración del equipo al dividir dicho volumen por el tiempo empleado.

En la práctica, uno de los procedimientos que se pueden utilizar para calibrar una bomba consiste en medir el tiempo que una pompa de jabón creada en una bureta invertida tarda en recorrer una determinada distancia, es decir, en desplazar un determinado volumen e aire.

El caudal de aspiración se calcula mediante la expresión:

Q    V/T

W donde:
Q: caudal de aspiración de la bomba en l/min.
V: volumen de la bureta en litros.
t: tiempo empleado por la pompa de jabón en recorrer el volumen V en minutos.

Hay que tener en cuenta que la calibración de las bombas debe hacerse con el mismo soporte (filtro, tubo, etc.) que se va a utilizar durante el muestreo, poco antes de comenzar el mismo.